Cobalt in the structure of Solution Structure of A Dna Holliday Junction (pdb 2f1q)

The binding sites of Cobalt atom in the structure of Solution Structure of A Dna Holliday Junction (pdb code 2f1q). This binding sites where shown with 5.0 Angstroms radius around Cobalt atom. The 2f1q structure was solved by B.WU, B.N.M.VAN BUUREN, J.SCHLEUCHER, S.S.WIJMENGA, with NMR in Solution technique. Cobalt Binding Sites: Cobalt binding site 1 out of 1 in 2f1q Click to enlarge Click to enlarge Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 1 of Cobalt in the PDB 2f1q. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Cobalt atom, shown by VdW sphere Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Dg15, A: Da16, A: Nco43, A: Dg15, A: Da16, A: Nco43, A: Dg15, A: Nco43, A: Dc10, A: Dg14, A: Dg15, A: Nco43, A: Dc10, A: Dg14, A: Dg15, A: Nco43, A: Dg15, A: Da16, A: Nco43, A: Dc10, A: Dg15, A: Nco43, A: Dc10, A: Dg15, A: Nco43, A: Dc10, A: Dg14, A: Dg15, A: Nco43, A: Dc10, A: Dg15, A: Nco43, A: Dc10, A: Dg14, A: Dg15, A: Nco43, A: Dc10, A: Dg14, A: Dg15, A: Nco43, A: Dc10, A: Dg14, A: Dg15, A: Da16, A: Nco43, conact list: Atom Atom Distance (A) Co O6 A:Dg15 4.77 Co H62 A:Da16 4.79 Co HN61 A:Nco43 2.56 Co HN11 A:Nco43 2.55 Co N3 A:Nco43 2.01 Co N2 A:Nco43 2.01 Co HN41 A:Nco43 2.56 Co HN62 A:Nco43 2.55 Co HN33 A:Nco43 2.55 Co HN51 A:Nco43 2.55 Co HN42 A:Nco43 2.56 Co HN21 A:Nco43 2.56 Co N5 A:Nco43 2.01 Co HN43 A:Nco43 2.57 Co HN12 A:Nco43 2.57 Co HN52 A:Nco43 2.57 Co N1 A:Nco43 2.01 Co N6 A:Nco43 2.01 Co CO A:Nco43 0.00 Co HN23 A:Nco43 2.57 Co HN22 A:Nco43 2.55 Co HN32 A:Nco43 2.56 Co HN63 A:Nco43 2.57 Co HN31 A:Nco43 2.57 Co HN53 A:Nco43 2.56 Co N4 A:Nco43 2.01 Co HN13 A:Nco43 2.56 Co O6 A:Dg15 4.77 Co H62 A:Da16 4.79 Co HN61 A:Nco43 2.56 Co HN11 A:Nco43 2.55 Co N3 A:Nco43 2.01 Co N2 A:Nco43 2.01 Co HN41 A:Nco43 2.56 Co HN62 A:Nco43 2.55 Co HN33 A:Nco43 2.55 Co HN51 A:Nco43 2.55 Co HN42 A:Nco43 2.56 Co HN21 A:Nco43 2.56 Co N5 A:Nco43 2.01 Co HN43 A:Nco43 2.57 Co HN12 A:Nco43 2.57 Co HN52 A:Nco43 2.57 Co N1 A:Nco43 2.01 Co N6 A:Nco43 2.01 Co CO A:Nco43 0.00 Co HN23 A:Nco43 2.57 Co HN22 A:Nco43 2.55 Co HN32 A:Nco43 2.56 Co HN63 A:Nco43 2.57 Co HN31 A:Nco43 2.57 Co HN53 A:Nco43 2.56 Co N4 A:Nco43 2.01 Co HN13 A:Nco43 2.56 Co O6 A:Dg15 4.77 Co HN61 A:Nco43 2.56 Co HN11 A:Nco43 2.55 Co N3 A:Nco43 2.01 Co N2 A:Nco43 2.01 Co HN41 A:Nco43 2.56 Co HN62 A:Nco43 2.55 Co HN33 A:Nco43 2.55 Co HN51 A:Nco43 2.55 Co HN42 A:Nco43 2.56 Co HN21 A:Nco43 2.56 Co N5 A:Nco43 2.01 Co HN43 A:Nco43 2.57 Co HN12 A:Nco43 2.57 Co HN52 A:Nco43 2.57 Co N1 A:Nco43 2.01 Co N6 A:Nco43 2.01 Co CO A:Nco43 0.00 Co HN23 A:Nco43 2.57 Co HN22 A:Nco43 2.55 Co HN32 A:Nco43 2.56 Co HN63 A:Nco43 2.57 Co HN31 A:Nco43 2.57 Co HN53 A:Nco43 2.56 Co N4 A:Nco43 2.01 Co HN13 A:Nco43 2.56 Co O6 A:Dg15 4.77 Co HN61 A:Nco43 2.56 Co HN11 A:Nco43 2.55 Co N3 A:Nco43 2.01 Co N2 A:Nco43 2.01 Co HN41 A:Nco43 2.56 Co HN62 A:Nco43 2.55 Co HN33 A:Nco43 2.55 Co HN51 A:Nco43 2.55 Co HN42 A:Nco43 2.56 Co HN21 A:Nco43 2.56 Co N5 A:Nco43 2.01 Co HN43 A:Nco43 2.57 Co HN12 A:Nco43 2.57 Co HN52 A:Nco43 2.57 Co N1 A:Nco43 2.01 Co N6 A:Nco43 2.01 Co CO A:Nco43 0.00 Co HN23 A:Nco43 2.57 Co HN22 A:Nco43 2.55 Co HN32 A:Nco43 2.56 Co HN63 A:Nco43 2.57 Co HN31 A:Nco43 2.57 Co HN53 A:Nco43 2.56 Co N4 A:Nco43 2.01 Co HN13 A:Nco43 2.56 Co O6 A:Dg15 4.77 Co HN61 A:Nco43 2.56 Co HN11 A:Nco43 2.55 Co N3 A:Nco43 2.01 Co N2 A:Nco43 2.01 Co HN41 A:Nco43 2.56 Co HN62 A:Nco43 2.55 Co HN33 A:Nco43 2.55 Co HN51 A:Nco43 2.55 Co HN42 A:Nco43 2.56 Co HN21 A:Nco43 2.56 Co N5 A:Nco43 2.01 Co HN43 A:Nco43 2.57 Co HN12 A:Nco43 2.57 Co HN52 A:Nco43 2.57 Co N1 A:Nco43 2.01 Co N6 A:Nco43 2.01 Co CO A:Nco43 0.00 Co HN23 A:Nco43 2.57 Co HN22 A:Nco43 2.55 Co HN32 A:Nco43 2.56 Co HN63 A:Nco43 2.57 Co HN31 A:Nco43 2.57 Co HN53 A:Nco43 2.56 Co N4 A:Nco43 2.01 Co HN13 A:Nco43 2.56 Co O6 A:Dg15 4.77 Co H62 A:Da16 4.79 Co HN61 A:Nco43 2.56 Co HN11 A:Nco43 2.55 Co N3 A:Nco43 2.01 Co N2 A:Nco43 2.01 Co HN41 A:Nco43 2.56 Co HN62 A:Nco43 2.55 Co HN33 A:Nco43 2.55 Co HN51 A:Nco43 2.55 Co HN42 A:Nco43 2.56 Co HN21 A:Nco43 2.56 Co N5 A:Nco43 2.01 Co HN43 A:Nco43 2.57 Co HN12 A:Nco43 2.57 Co HN52 A:Nco43 2.57 Co N1 A:Nco43 2.01 Co N6 A:Nco43 2.01 Co CO A:Nco43 0.00 Co HN23 A:Nco43 2.57 Co HN22 A:Nco43 2.55 Co HN32 A:Nco43 2.56 Co HN63 A:Nco43 2.57 Co HN31 A:Nco43 2.57 Co HN53 A:Nco43 2.56 Co N4 A:Nco43 2.01 Co HN13 A:Nco43 2.56 Co O6 A:Dg15 4.77 Co HN61 A:Nco43 2.56 Co HN11 A:Nco43 2.55 Co N3 A:Nco43 2.01 Co N2 A:Nco43 2.01 Co HN41 A:Nco43 2.56 Co HN62 A:Nco43 2.55 Co HN33 A:Nco43 2.55 Co HN51 A:Nco43 2.55 Co HN42 A:Nco43 2.56 Co HN21 A:Nco43 2.56 Co N5 A:Nco43 2.01 Co HN43 A:Nco43 2.57 Co HN12 A:Nco43 2.57 Co HN52 A:Nco43 2.57 Co N1 A:Nco43 2.01 Co N6 A:Nco43 2.01 Co CO A:Nco43 0.00 Co HN23 A:Nco43 2.57 Co HN22 A:Nco43 2.55 Co HN32 A:Nco43 2.56 Co HN63 A:Nco43 2.57 Co HN31 A:Nco43 2.57 Co HN53 A:Nco43 2.56 Co N4 A:Nco43 2.01 Co HN13 A:Nco43 2.56 Co O6 A:Dg15 4.77 Co HN61 A:Nco43 2.56 Co HN11 A:Nco43 2.55 Co N3 A:Nco43 2.01 Co N2 A:Nco43 2.01 Co HN41 A:Nco43 2.56 Co HN62 A:Nco43 2.55 Co HN33 A:Nco43 2.55 Co HN51 A:Nco43 2.55 Co HN42 A:Nco43 2.56 Co HN21 A:Nco43 2.56 Co N5 A:Nco43 2.01 Co HN43 A:Nco43 2.57 Co HN12 A:Nco43 2.57 Co HN52 A:Nco43 2.57 Co N1 A:Nco43 2.01 Co N6 A:Nco43 2.01 Co CO A:Nco43 0.00 Co HN23 A:Nco43 2.57 Co HN22 A:Nco43 2.55 Co HN32 A:Nco43 2.56 Co HN63 A:Nco43 2.57 Co HN31 A:Nco43 2.57 Co HN53 A:Nco43 2.56 Co N4 A:Nco43 2.01 Co HN13 A:Nco43 2.56 Co O6 A:Dg15 4.77 Co HN61 A:Nco43 2.56 Co HN11 A:Nco43 2.55 Co N3 A:Nco43 2.01 Co N2 A:Nco43 2.01 Co HN41 A:Nco43 2.56 Co HN62 A:Nco43 2.55 Co HN33 A:Nco43 2.55 Co HN51 A:Nco43 2.55 Co HN42 A:Nco43 2.56 Co HN21 A:Nco43 2.56 Co N5 A:Nco43 2.01 Co HN43 A:Nco43 2.57 Co HN12 A:Nco43 2.57 Co HN52 A:Nco43 2.57 Co N1 A:Nco43 2.01 Co N6 A:Nco43 2.01 Co CO A:Nco43 0.00 Co HN23 A:Nco43 2.57 Co HN22 A:Nco43 2.55 Co HN32 A:Nco43 2.56 Co HN63 A:Nco43 2.57 Co HN31 A:Nco43 2.57 Co HN53 A:Nco43 2.56 Co N4 A:Nco43 2.01 Co HN13 A:Nco43 2.56 Co O6 A:Dg15 4.77 Co HN61 A:Nco43 2.56 Co HN11 A:Nco43 2.55 Co N3 A:Nco43 2.01 Co N2 A:Nco43 2.01 Co HN41 A:Nco43 2.56 Co HN62 A:Nco43 2.55 Co HN33 A:Nco43 2.55 Co HN51 A:Nco43 2.55 Co HN42 A:Nco43 2.56 Co HN21 A:Nco43 2.56 Co N5 A:Nco43 2.01 Co HN43 A:Nco43 2.57 Co HN12 A:Nco43 2.57 Co HN52 A:Nco43 2.57 Co N1 A:Nco43 2.01 Co N6 A:Nco43 2.01 Co CO A:Nco43 0.00 Co HN23 A:Nco43 2.57 Co HN22 A:Nco43 2.55 Co HN32 A:Nco43 2.56 Co HN63 A:Nco43 2.57 Co HN31 A:Nco43 2.57 Co HN53 A:Nco43 2.56 Co N4 A:Nco43 2.01 Co HN13 A:Nco43 2.56 Co O6 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