Cobalt in the structure of Solution Structure Of the Rnase P Rna (M1 Rna) P4 Stem Oligoribonucleotide Complexed With Cobalt (III) Hexamine, uc(Nmr), Ensemble of 11 Structures (pdb 1f7h)

The binding sites of Cobalt atom in the structure of Solution Structure Of the Rnase P Rna (M1 Rna) P4 Stem Oligoribonucleotide Complexed With Cobalt (III) Hexamine, uc(Nmr), Ensemble of 11 Structures (pdb code 1f7h). This binding sites where shown with 5.0 Angstroms radius around Cobalt atom. The 1f7h structure was solved by M.SCHMITZ, I.TINOCO JR., with NMR in Solution technique. Cobalt Binding Sites: Cobalt binding site 1 out of 1 in 1f7h Click to enlarge Click to enlarge Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 1 of Cobalt in the PDB 1f7h. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Cobalt atom, shown by VdW sphere Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: G5, A: C19, A: C20, A: Nco28, A: C8, A: G9, A: C20, A: G21, A: Nco28, A: C8, A: G9, A: C20, A: G21, A: Nco28, A: G5, A: C8, A: G9, A: C20, A: G21, A: Nco28, A: C8, A: G9, A: C19, A: C20, A: G21, A: Nco28, A: C8, A: G9, A: C20, A: G21, A: Nco28, A: C8, A: G9, A: C19, A: C20, A: G21, A: Nco28, A: C8, A: G9, A: C19, A: C20, A: G21, A: Nco28, A: C8, A: G9, A: C19, A: C20, A: G21, A: Nco28, A: C8, A: G9, A: C20, A: G21, A: Nco28, A: C8, A: G9, A: C20, A: G21, A: Nco28, conact list: Atom Atom Distance (A) Co C8 A:G5 4.96 Co H8 A:G5 4.68 Co N7 A:G5 4.59 Co H42 A:C19 4.91 Co H42 A:C20 4.99 Co HN61 A:Nco28 2.54 Co HN11 A:Nco28 2.54 Co N3 A:Nco28 1.99 Co N2 A:Nco28 2.00 Co HN41 A:Nco28 2.54 Co HN62 A:Nco28 2.55 Co HN33 A:Nco28 2.54 Co HN51 A:Nco28 2.55 Co HN42 A:Nco28 2.55 Co HN21 A:Nco28 2.55 Co N5 A:Nco28 1.99 Co HN43 A:Nco28 2.54 Co HN12 A:Nco28 2.54 Co HN52 A:Nco28 2.54 Co N1 A:Nco28 1.99 Co N6 A:Nco28 1.99 Co CO A:Nco28 0.00 Co HN23 A:Nco28 2.54 Co HN22 A:Nco28 2.55 Co HN32 A:Nco28 2.54 Co HN63 A:Nco28 2.54 Co HN31 A:Nco28 2.54 Co HN53 A:Nco28 2.54 Co N4 A:Nco28 1.99 Co HN13 A:Nco28 2.55 Co H42 A:C20 4.99 Co HN61 A:Nco28 2.54 Co HN11 A:Nco28 2.54 Co N3 A:Nco28 1.99 Co N2 A:Nco28 2.00 Co HN41 A:Nco28 2.54 Co HN62 A:Nco28 2.55 Co HN33 A:Nco28 2.54 Co HN51 A:Nco28 2.55 Co HN42 A:Nco28 2.55 Co HN21 A:Nco28 2.55 Co N5 A:Nco28 1.99 Co HN43 A:Nco28 2.54 Co HN12 A:Nco28 2.54 Co HN52 A:Nco28 2.54 Co N1 A:Nco28 1.99 Co N6 A:Nco28 1.99 Co CO A:Nco28 0.00 Co HN23 A:Nco28 2.54 Co HN22 A:Nco28 2.55 Co HN32 A:Nco28 2.54 Co HN63 A:Nco28 2.54 Co HN31 A:Nco28 2.54 Co HN53 A:Nco28 2.54 Co N4 A:Nco28 1.99 Co HN13 A:Nco28 2.55 Co H42 A:C20 4.99 Co HN61 A:Nco28 2.54 Co HN11 A:Nco28 2.54 Co N3 A:Nco28 1.99 Co N2 A:Nco28 2.00 Co HN41 A:Nco28 2.54 Co HN62 A:Nco28 2.55 Co HN33 A:Nco28 2.54 Co HN51 A:Nco28 2.55 Co HN42 A:Nco28 2.55 Co HN21 A:Nco28 2.55 Co N5 A:Nco28 1.99 Co HN43 A:Nco28 2.54 Co HN12 A:Nco28 2.54 Co HN52 A:Nco28 2.54 Co N1 A:Nco28 1.99 Co N6 A:Nco28 1.99 Co CO A:Nco28 0.00 Co HN23 A:Nco28 2.54 Co HN22 A:Nco28 2.55 Co HN32 A:Nco28 2.54 Co HN63 A:Nco28 2.54 Co HN31 A:Nco28 2.54 Co HN53 A:Nco28 2.54 Co N4 A:Nco28 1.99 Co HN13 A:Nco28 2.55 Co C8 A:G5 4.96 Co H8 A:G5 4.68 Co N7 A:G5 4.59 Co H42 A:C20 4.99 Co HN61 A:Nco28 2.54 Co HN11 A:Nco28 2.54 Co N3 A:Nco28 1.99 Co N2 A:Nco28 2.00 Co HN41 A:Nco28 2.54 Co HN62 A:Nco28 2.55 Co HN33 A:Nco28 2.54 Co HN51 A:Nco28 2.55 Co HN42 A:Nco28 2.55 Co HN21 A:Nco28 2.55 Co N5 A:Nco28 1.99 Co HN43 A:Nco28 2.54 Co HN12 A:Nco28 2.54 Co HN52 A:Nco28 2.54 Co N1 A:Nco28 1.99 Co N6 A:Nco28 1.99 Co CO A:Nco28 0.00 Co HN23 A:Nco28 2.54 Co HN22 A:Nco28 2.55 Co HN32 A:Nco28 2.54 Co HN63 A:Nco28 2.54 Co HN31 A:Nco28 2.54 Co HN53 A:Nco28 2.54 Co N4 A:Nco28 1.99 Co HN13 A:Nco28 2.55 Co H42 A:C19 4.91 Co H42 A:C20 4.99 Co HN61 A:Nco28 2.54 Co HN11 A:Nco28 2.54 Co N3 A:Nco28 1.99 Co N2 A:Nco28 2.00 Co HN41 A:Nco28 2.54 Co HN62 A:Nco28 2.55 Co HN33 A:Nco28 2.54 Co HN51 A:Nco28 2.55 Co HN42 A:Nco28 2.55 Co HN21 A:Nco28 2.55 Co N5 A:Nco28 1.99 Co HN43 A:Nco28 2.54 Co HN12 A:Nco28 2.54 Co HN52 A:Nco28 2.54 Co N1 A:Nco28 1.99 Co N6 A:Nco28 1.99 Co CO A:Nco28 0.00 Co HN23 A:Nco28 2.54 Co HN22 A:Nco28 2.55 Co HN32 A:Nco28 2.54 Co HN63 A:Nco28 2.54 Co HN31 A:Nco28 2.54 Co HN53 A:Nco28 2.54 Co N4 A:Nco28 1.99 Co HN13 A:Nco28 2.55 Co H42 A:C20 4.99 Co HN61 A:Nco28 2.54 Co HN11 A:Nco28 2.54 Co N3 A:Nco28 1.99 Co N2 A:Nco28 2.00 Co HN41 A:Nco28 2.54 Co HN62 A:Nco28 2.55 Co HN33 A:Nco28 2.54 Co HN51 A:Nco28 2.55 Co HN42 A:Nco28 2.55 Co HN21 A:Nco28 2.55 Co N5 A:Nco28 1.99 Co HN43 A:Nco28 2.54 Co HN12 A:Nco28 2.54 Co HN52 A:Nco28 2.54 Co N1 A:Nco28 1.99 Co N6 A:Nco28 1.99 Co CO A:Nco28 0.00 Co HN23 A:Nco28 2.54 Co HN22 A:Nco28 2.55 Co HN32 A:Nco28 2.54 Co HN63 A:Nco28 2.54 Co HN31 A:Nco28 2.54 Co HN53 A:Nco28 2.54 Co N4 A:Nco28 1.99 Co HN13 A:Nco28 2.55 Co H42 A:C19 4.91 Co H42 A:C20 4.99 Co HN61 A:Nco28 2.54 Co HN11 A:Nco28 2.54 Co N3 A:Nco28 1.99 Co N2 A:Nco28 2.00 Co HN41 A:Nco28 2.54 Co HN62 A:Nco28 2.55 Co HN33 A:Nco28 2.54 Co HN51 A:Nco28 2.55 Co HN42 A:Nco28 2.55 Co HN21 A:Nco28 2.55 Co N5 A:Nco28 1.99 Co HN43 A:Nco28 2.54 Co HN12 A:Nco28 2.54 Co HN52 A:Nco28 2.54 Co N1 A:Nco28 1.99 Co N6 A:Nco28 1.99 Co CO A:Nco28 0.00 Co HN23 A:Nco28 2.54 Co HN22 A:Nco28 2.55 Co HN32 A:Nco28 2.54 Co HN63 A:Nco28 2.54 Co HN31 A:Nco28 2.54 Co HN53 A:Nco28 2.54 Co N4 A:Nco28 1.99 Co HN13 A:Nco28 2.55 Co H42 A:C19 4.91 Co H42 A:C20 4.99 Co HN61 A:Nco28 2.54 Co HN11 A:Nco28 2.54 Co N3 A:Nco28 1.99 Co N2 A:Nco28 2.00 Co HN41 A:Nco28 2.54 Co HN62 A:Nco28 2.55 Co HN33 A:Nco28 2.54 Co HN51 A:Nco28 2.55 Co HN42 A:Nco28 2.55 Co HN21 A:Nco28 2.55 Co N5 A:Nco28 1.99 Co HN43 A:Nco28 2.54 Co HN12 A:Nco28 2.54 Co HN52 A:Nco28 2.54 Co N1 A:Nco28 1.99 Co N6 A:Nco28 1.99 Co CO A:Nco28 0.00 Co HN23 A:Nco28 2.54 Co HN22 A:Nco28 2.55 Co HN32 A:Nco28 2.54 Co HN63 A:Nco28 2.54 Co HN31 A:Nco28 2.54 Co HN53 A:Nco28 2.54 Co N4 A:Nco28 1.99 Co HN13 A:Nco28 2.55 Co H42 A:C19 4.91 Co H42 A:C20 4.99 Co HN61 A:Nco28 2.54 Co HN11 A:Nco28 2.54 Co N3 A:Nco28 1.99 Co N2 A:Nco28 2.00 Co HN41 A:Nco28 2.54 Co HN62 A:Nco28 2.55 Co HN33 A:Nco28 2.54 Co HN51 A:Nco28 2.55 Co HN42 A:Nco28 2.55 Co HN21 A:Nco28 2.55 Co N5 A:Nco28 1.99 Co HN43 A:Nco28 2.54 Co HN12 A:Nco28 2.54 Co HN52 A:Nco28 2.54 Co N1 A:Nco28 1.99 Co N6 A:Nco28 1.99 Co CO A:Nco28 0.00 Co HN23 A:Nco28 2.54 Co HN22 A:Nco28 2.55 Co HN32 A:Nco28 2.54 Co HN63 A:Nco28 2.54 Co HN31 A:Nco28 2.54 Co HN53 A:Nco28 2.54 Co N4 A:Nco28 1.99 Co HN13 A:Nco28 2.55 Co H42 A:C20 4.99 Co HN61 A:Nco28 2.54 Co HN11 A:Nco28 2.54 Co N3 A:Nco28 1.99 Co N2 A:Nco28 2.00 Co HN41 A:Nco28 2.54 Co HN62 A:Nco28 2.55 Co HN33 A:Nco28 2.54 Co HN51 A:Nco28 2.55 Co HN42 A:Nco28 2.55 Co HN21 A:Nco28 2.55 Co N5 A:Nco28 1.99 Co HN43 A:Nco28 2.54 Co HN12 A:Nco28 2.54 Co HN52 A:Nco28 2.54 Co N1 A:Nco28 1.99 Co N6 A:Nco28 1.99 Co CO A:Nco28 0.00 Co HN23 A:Nco28 2.54 Co HN22 A:Nco28 2.55 Co HN32 A:Nco28 2.54 Co HN63 A:Nco28 2.54 Co HN31 A:Nco28 2.54 Co HN53 A:Nco28 2.54 Co N4 A:Nco28 1.99 Co HN13 A:Nco28 2.55 Co H42 A:C20 4.99 Co HN61 A:Nco28 2.54 Co HN11 A:Nco28 2.54 Co N3 A:Nco28 1.99 Co N2 A:Nco28 2.00 Co HN41 A:Nco28 2.54 Co HN62 A:Nco28 2.55 Co HN33 A:Nco28 2.54 Co HN51 A:Nco28 2.55 Co HN42 A:Nco28 2.55 Co HN21 A:Nco28 2.55 Co N5 A:Nco28 1.99 Co HN43 A:Nco28 2.54 Co HN12 A:Nco28 2.54 Co HN52 A:Nco28 2.54 Co N1 A:Nco28 1.99 Co N6 A:Nco28 1.99 Co CO A:Nco28 0.00 Co HN23 A:Nco28 2.54 Co HN22 A:Nco28 2.55 Co HN32 A:Nco28 2.54 Co HN63 A:Nco28 2.54 Co HN31 A:Nco28 2.54 Co HN53 A:Nco28 2.54 Co N4 A:Nco28 1.99 Co HN13 A:Nco28 2.55 interactive model: